수술 중, 수술 후의 합병증으로서는 안구내염, 동공편위, 녹내장, 망막박리, 각막부종, 낭포황반부종, 전방출혈, 유리체출혈, 후낭혼탁(후발백내장) 등이 발생할 수 있다. 감염으로 발생하는 안구내염(눈속염)은 심각한 시력장애를 초래하나 1,000건당 약 2~4건의 매우 낮은 빈도로 발생한다. 후낭혼탁은 소아의 경우에는 흔히 발생하고, 어른의 경우에는 백내장수술 후 3~5년이 경과하면 약 30~50%에서 발생한다. 시력장애가 있거나 안저검사가 힘들 때, 한눈복시가 있을 때에는 야그레이저로 혼탁한 후낭에 구멍을 만들어주는 치료를 하기도 한다.